Wskutek nieszczęśliwego wypadku lub rzadkich powikłań w trakcie konwencjonalnego leczenia, w obrębie zdrowych tkanek mogą znaleźć się niepożądane ciała obce spoza organizmu oraz niekorzystnie umiejscowione obumarłe tkanki własne. Niektóre z dotychczas usuniętych ciał obcych:
fragmenty korzeni zębów pozostawione w kości lub wtłoczone w obręb zatok szczękowych;
całe zęby przemieszczone w obręb tkanek miękkich podczas nieudanych prób usunięcia;
przepchnięte poza wierzchołek korzenia zęba materiały i narzędzia służące do leczenia kanałowego;
śrut, materiały służące leczeniu kanałowemu oraz grzybnia zlokalizowane w obrębie zatok szczękowych.
Stosunkowo częstym powikłaniem usuwania górnych zębów przedtrzonowych i trzonowych jest nieintencjonalne otwarcie zatoki szczękowej. Pilna interwencja chirurgiczna pozwala wówczas na szczelne zamknięcie otwartej zatoki bez konieczności hospitalizacji.